隨著2007年推出為期五年的學券計畫將於本學年(2011至2012年度)結束，不少名牌幼稚園都相繼宣報將於明年(2012至2013年度)退出學券計畫。幼稚園選擇退出的原因，其一是近年通脹持續上升，加上最低工資的影響，令幼稚園的營運壓力不斷增加，但在學券計劃之下，學費卻被24,000元的上限封頂，更不能在5年內調整學費，令幼稚園失去財政自主的選擇和彈性，甚至因無奈凍薪而影響教育質素。
另一個令幼稚園爆發退出學券潮的原因，是學券制的得益者是受助的家長，但對學校而言，最多只是多了一群因有學費減免而申請的學生，根本無任何實質好處，反而卻因參與計劃而處處受到規管和限制。所以，對於一些學位千金難求，家長爭相報讀的名牌幼稚園，根本不愁收生，又何需作作繭自縛呢？
雖然根據教育局的回應，目前仍然有八成幼稚園參加學券計劃，但由於退出的普遍都是受家長歡迎的傳統名校，難免給人"有能力"或"較優良"的學校都會退出學券制的感覺，而"接受學券"的學校則會被負面標纖化。若當局仍不改善計劃以回應各方面的強烈訴求，最終只能看見學券制逐漸步進全盤失敗的陰霾。
已宣報2012-13年度退出學券制的幼稚園名單
聖公會幼稚園
天主教聖猶達幼稚園*
香港靈糧堂幼稚園
聖公會幼稚園（畢拉山）
聖保祿幼稚園
九龍禮賢學校
鑽石山靈糧幼稚園
宣道幼稚園
啟思幼稚園（九龍塘正校）
民生書院 （幼稚園部）
*將於2012年9月起易名為高主教書院(幼稚園部)
另一個令幼稚園爆發退出學券潮的原因，是學券制的得益者是受助的家長，但對學校而言，最多只是多了一群因有學費減免而申請的學生，根本無任何實質好處，反而卻因參與計劃而處處受到規管和限制。所以，對於一些學位千金難求，家長爭相報讀的名牌幼稚園，根本不愁收生，又何需作作繭自縛呢？
雖然根據教育局的回應，目前仍然有八成幼稚園參加學券計劃，但由於退出的普遍都是受家長歡迎的傳統名校，難免給人"有能力"或"較優良"的學校都會退出學券制的感覺，而"接受學券"的學校則會被負面標纖化。若當局仍不改善計劃以回應各方面的強烈訴求，最終只能看見學券制逐漸步進全盤失敗的陰霾。
已宣報2012-13年度退出學券制的幼稚園名單
聖公會幼稚園
天主教聖猶達幼稚園*
香港靈糧堂幼稚園
聖公會幼稚園（畢拉山）
聖保祿幼稚園
九龍禮賢學校
鑽石山靈糧幼稚園
宣道幼稚園
啟思幼稚園（九龍塘正校）
民生書院 （幼稚園部）
*將於2012年9月起易名為高主教書院(幼稚園部)